在經過了近3個月之后，柯慶生再次發表公開的講話，警告扁當局必須在偏激的路線上止步，說明了有幾個嚴峻的問題存在：一，扁當局對美國苦口婆心的勸諭根本就當作耳邊風，不當一回事，我行我素，不予理睬，美國的壓力無濟于事。二，臺灣社會在“入聯公投”的刺激之下，社會大動亂因素累增，不可遏制的危機在蓄勢待發。三，大陸高度戒備，并有可能采取應對強硬的措施，對美國的壓力越來越大。四，美國如果無法在今次的政治沖突中占上風，與臺灣關系的發展可能會偏離軌道。
社評指出，柯慶生的不斷喊話，既表明了美國的立場，也反映了美國的焦慮及無奈！在扁當局根本不予以理睬的情況下，柯慶生說，美國要持續表達關切，讓臺灣人民瞭解美國的態度。
據中國評論通訊社報道，中國國家主席胡錦濤6日晚上應約同美國總統布什通電話，談及臺灣“入聯公投”。胡錦濤指出，妥善處理臺灣問題是確保中美關系穩定健康發展的關鍵。臺灣當局正變本加厲地推行“入聯公投”等“臺獨”分裂活動，對臺海和平穩定構成嚴重威脅和挑戰。堅決反對和制止“臺獨”，維護臺海和平穩定，符合中美共同戰略利益。
大陸對美的壓力持續不斷，美國無法含糊其辭。胡錦濤的話講得非常清楚：一，“入聯公投”危害兩岸關系。二，中國大陸必然要反對和制止。三，希望美國參與妥善處理。四，如果美國縱容“臺獨”，中美利益將受到嚴重損害。社評認為，可以說，中國大陸持續不斷的壓力，是美國政府不斷對扁當局施加政治壓力的根本原因。
柯慶生是布什政府高層的重要的“中國通”。2006年7月中旬，普林斯頓大學教授柯慶生走馬上任，成為國務院東亞和太平洋事務局的新的助理國務卿。柯慶生8月3日在美中經濟與安全評估委員會的證詞表明，他將延續佐利克的對華政策。佐利克離任后，從國務卿到副國務卿沒有一位是中國問題專家。柯慶生是從國務卿以下到他這個層面國務院中唯一的中國問題專家，承擔制定對華政策的重擔。柯慶生對中美關系的看法是樂觀的。他在證詞最后說：“在過去27年中，兩國之間有共同利益的領域在不斷增長。我要說，這樣的領域將會繼續增長。”有柯慶生這樣的明白人，兩岸危機沖突有可能會減低很多很多！
